BLAST ialah algoritma komputer yang tersedia untuk digunakan dalam talian di tapak web Pusat Maklumat Bioteknologi Kebangsaan (NCBI), serta banyak tapak lain. BLAST boleh menyelaraskan dan membandingkan dengan pantas urutan DNA pertanyaan dengan pangkalan data jujukan, yang menjadikannya alat penting dalam penyelidikan genomik yang berterusan.
Adakah BLAST pangkalan data utama?
BLAST ialah perisian yang paling banyak digunakan dalam penyelidikan bioinformatik. Fungsi utamanya ialah untuk membandingkan jujukan minat, jujukan pertanyaan, dengan jujukan dalam pangkalan data besar BLAST kemudian melaporkan padanan terbaik, atau “hits,” yang terdapat dalam pangkalan data. Program ringkas ini mempunyai dua aplikasi utama.
Adakah NCBI pangkalan data?
NCBI menempatkan serangkaian pangkalan data yang berkaitan dengan bioteknologi dan bioperubatan dan merupakan sumber penting untuk alatan dan perkhidmatan bioinformatik. Pangkalan data utama termasuk GenBank untuk urutan DNA dan PubMed, pangkalan data bibliografi untuk kesusasteraan bioperubatan. Pangkalan data lain termasuk pangkalan data NCBI Epigenomics.
Adakah BLAST hanya digunakan dalam pangkalan data NCBI?
BLAST tersedia di web di tapak web NCBI. Jenis BLAST yang berbeza tersedia mengikut urutan pertanyaan dan pangkalan data sasaran.
Bagaimanakah pangkalan data BLAST berfungsi?
Bagaimanakah BLAST berfungsi? BLAST mengenal pasti jujukan homolog menggunakan kaedah heuristik yang pada mulanya mencari padanan pendek antara dua jujukan; oleh itu, kaedah ini tidak mengambil kira keseluruhan ruang urutan. Selepas perlawanan awal, BLAST cuba memulakan penjajaran tempatan daripada padanan awal ini.
