Apakah fail bigwig?

Isi kandungan:

Apakah fail bigwig?
Apakah fail bigwig?

Video: Apakah fail bigwig?

Video: Apakah fail bigwig?
Video: Converting BAM to BigWig 2024, November
Anonim

BigWig ialah format fail untuk paparan padat, data berterusan dalam runut penyemak imbas genom, dicipta melalui penukaran daripada format Wiggle (WIG). Format BigWig diterangkan di tapak web UCSC Genome Bioinformatics, dan panduan format fail Broad Institute menyediakan maklumat tambahan.

Apakah format bigWig?

Format bigWig ialah untuk paparan padat, data berterusan yang akan dipaparkan sebagai graf Fail BigWig dibuat pada mulanya daripada fail jenis WIG, menggunakan program UCSC wigToBigWig. Sebagai alternatif, fail bigWig boleh dibuat daripada fail bedGraph, menggunakan program UCSC bedGraphToBigWig.

Bagaimana cara saya menggunakan fail bigWig?

Pindahkan fail bigWig yang baru dibuat (myBigWig.bw) ke http, https atau lokasi ftp yang boleh diakses web. Tampalkan URL ke dalam borang kemasukan trek tersuai atau bina runut tersuai menggunakan satu baris runut. Tampalkan baris trek tersuai ke dalam kotak teks pada halaman pengurusan trek tersuai.

Apakah itu lagu bigWig?

bigWig Tracks ialah track untuk isyarat berterusan merentas keseluruhan genom. Ia sesuai untuk memaparkan pelbagai hasil percubaan "mentah" seperti isyarat ChIP-Seq, isyarat RNA-Seq, dsb.

Bagaimanakah cara saya membuat fail bigWig?

Terdapat pelbagai cara untuk menjana fail bigwig. Ini biasanya melibatkan penukaran a. bam fail ke trek goyang (. rambut palsu) dan kemudian menukar trek goyang menjadi bigwig binari (.

Disyorkan: